Professional Documents
Culture Documents
Спирин
2006 г.
Лекция № 3
Рибосома: структура
ОСНОВНЫЕ ТИПЫ РИБОСОМ
RNA : PROTEIN,
W/W 2:1 1:1
MITOCHONDRIAL
75S RIBOSOMES
OF FUNGI
MITOCHONDRIAL
55S RIBOSOMES
("MINIRIBOSOMES")
OF MAMMALS
70S
50S + 30S
ДИССОЦИАЦИЯ - РЕАССОЦИАЦИЯ РИБОСОМ
70S
+ + 2+ 2+
N a ,Li M g , C a
+ +
K , N H 4 P O L Y A M IN E S
ETH A N O L,
U R EA
M ETH A N O L
30S
+
50S
30S РИБОСОМНАЯ СУБЧАСТИЦА
40S РИБОСОМНАЯ СУБЧАСТИЦА
50S РИБОСОМНАЯ СУБЧАСТИЦА
70S РИБОСОМА - АССОЦИАТ ДВУХ СУБЧАСТИЦ
КОНТУРЫ ДВУХ РИБОСОМНЫХ СУБЧАСТИЦ 70S
РИБОСОМЫ В ДВУХ ПРОЕКЦИЯХ
Сравнение размеров и формы рибосомных субъединиц
и их изолированных РНК в компактной конформации
6.4. From Moore and Steitz (2003) Ann. Rev. Biochem. 72: 813-850; Fig. 2.
Original from Klein et al. (2001) EMBO J. 20: 4214-4221.
UNCG TETRALOOP
Fig. 6.6. From Varani et al. (1991) Biochemistry 30: 3280-3289; (1995) J. Mol. Biol. 250: 333-353.
RICIN/SARCIN LOOP OF 23S/28S rRNA
apurinic site
tritin specific lyase
A
2660 A G
G A G GNRA tetraloop
C
A
G
G G A
U A
G C G
A C
U C A G
C G Side G loop
C G
2650 U A 2670
Non-canonic pairs
Fig. 6.5.
ПСЕВДОУЗЛЫ
6.7. From Pleij (1993) In “The RNA World”, CSHL Press, 609-613; Fig. 1 A, B.
ТРЕТИЧНАЯ СТРУКТУРА РНК:
дальние взаимодействия,
обеспечивающие компактное сворачивание РНК
6.15. From Nissen et al. (2001) PNAS 98: 4899-4903; Fig. 2c.
«А-минорное» взаимодействие между спиралями 23S рибосомной РНК:
4 стэкингованных аденозина противоположных цепей спирали Н68 домена IV
укладывается в малый желобок спирали H75 домена V
6.16. From Nissen et al. (2001) PNAS 98: 4899-4903; Fig. 2a.
«А-минорное» взаимодействие между спиралями рибосомной РНК:
Спираль 5S РНК и спираль Н38 23S РНК взаимодействуют своими
тройками стэкингованных аденозинов
6.20. From Nissen et al. (2001) PNAS 98: 4899-4903; Fig. 3b.
Домены рибосомной 23S РНК
PTC
M.M. Yusupov, G.Zh. Yusupova, A. Baucom, K. Lieberman, T.N. Earnest, J.H.D. Cate, H.F. Noller (2001)
Science 292: 883-896
БЕЛКИ 30S СУБЧАСТИЦЫ
E.coli
БЕЛКИ 50S СУБЧАСТИЦЫ
E.coli
ТОТАЛЬНЫЙ БЕЛОК 70S РИБОСОМЫ
E.coli
ТРЕТИЧНАЯ СТРУКТУРА 16S РНК (вверху) И
ТРЕТИЧНАЯ И ЧЕТВЕРТИЧНАЯ СТРУКТУРЫ 30S РИБОСОМНОЙ
СУБЧАСТИЦЫ (внизу)
B.T. Wimberly, D.E. Brodersen, W.M. Clemons, R.J. Morgan-Warren, A.P. Carter, C. Vonrhein,
T.Hartsch, V. Ramakrishnan (2000) Nature 407: 327-339
БОКОВАЯ И ВНЕШНЯЯ ПОВЕРХНОСТИ 50S РИБОСОМНОЙ
СУБЧАСТИЦЫ
SEDIMENTATION
16 S RNA COEFFICIENT IN
RECONSTITUTION BUFFER:
DOMAIN I DOMAIN II DOMAIN III 22S RNA
S4 S17 S8 S15 S7
Step I (+6 proteins)
S2
30S RNP
S1
СХЕМА РАЗВОРАЧИВАНИЯ РИБОСОМНОЙ 50S СУБЧАСТИЦЫ
В РИБОНУКЛЕОПРОТЕИДНЫЙ ТЯЖ ПРИ УДАЛЕНИИ Mg 2+ И СОЛЕЙ
Fig. 6.10.
50S РИБОСОМНАЯ СУБЧАСТИЦА
70S РИБОСОМА - АССОЦИАТ ДВУХ СУБЧАСТИЦ
ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ ТЕТРАПЕТЛИ С МАЛЫМ
ЖЕЛОБКОМ ДВОЙНОЙ СПИРАЛИ РНК
GAAA
tetraloop
Double
Tetraloop receptor helix
of small groove
of double helix
ТРЕТИЧНАЯ СТРУКТУРА 16S РИБОСОМНОЙ РНК
Компактные домены:
III
I II
M.M. Yusupov, G.Zh. Yusupova, A. Baucom, K. Lieberman, T.N. Earnest, J.H.D. Cate, H.F. Noller (2001)
Science 292: 883-896
КОНТАКТИРУЮЩАЯ ПОВЕРХНОСТЬ 50S РИБОСОМНОЙ
СУБЧАСТИЦЫ
M.M. Yusupov, G.Zh. Yusupova, A. Baucom, K. Lieberman, T.N. Earnest, J.H.D. Cate, H.F. Noller (2001)
Science 292: 883-896
ТРЕТИЧНАЯ СТРУКТУРА 23S РНК 50S РИБОСОМНОЙ СУБЧАСТИЦЫ